Wersja Selection została opracowana przez polski oddział Toyoty. Wyróżnia się dwukolorową kompozycją nadwozia i specjalnymi elementami wyposażenia.
W przypadku Aygo X połączenie kolorowego lakieru z czarnym dachem i tyłem auta jest oferowane już od wersji Style. Nowa wersja Selection została wzbogacona o dodatki podkreślające wyjątkowy charakter tego auta, w tym 18'' felgi aluminiowe czarne matowe z detalami w kolorze wybranego przez nas pakietu stylistycznego. Kompozycję uzupełnia zewnętrzy pakiet kolorystyczny obejmujacy listwy boczne i nakładki na zderzaki, a także elementy stylistyczne wnętrza i wzory na tapicerce w kolorach odpowiednich dla danego pakietu stylistycznego.
Wersja Selection została wyposażona też w system bezkluczykowego dostępu do samochodu (Inteligentny kluczyk), uruchamianie silnika przyciskiem oraz zdalne sterowanie klimatyzacją poprzez aplikację MyT. Kierowca ma do dyspozycji także system multimedialny Toyota Smart Connect® z kolorowym ekranem dotykowym (9'' HD), bezprzewodowe połączenie telefonu z Apple CarPlay* i Android Auto™ oraz nawigację Connected z mapami online i 4-letnią darmową transmisją danych.
Auto posiada także automatyczną klimatyzację, przednie i tylne czujniki parkowania, kamerę cofania, podgrzewane fotele, komplet systemów bezpieczeństwa czynnego, a opcjonalnie także Pakiet Skyview Air, czyli elektrycznie otwierany miękki dach.